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Genetica medica

Dalla metagenomica la mappa dell’antibiotico-resistenza


La resistenza antimicrobica si verifica quando trattamenti precedentemente efficaci per combattere i microrganismi - compresi batteri, virus e alcuni tipi di parassiti - diventano inefficaci.

Quando accade, i problemi che ne derivano possono rapidamente diffondersi in ampi segmenti della popolazione. I risultati di un nuovo studio potrebbero far luce su quali aree del mondo hanno i problemi più sostanziali con la resistenza antimicrobica: i ricercatori hanno rivolto la loro attenzione alla metagenomica, un approccio basato sull'utilizzo di tecniche genomiche moderne per lo studio di comunità microbiche direttamente nel loro ambiente naturale, evitando così il problema del prelevamento e coltivazione in laboratorio. In questo caso, i campioni provenivano da liquami domestici. Dopo aver esaminato la presenza di batteri resistenti agli antibiotici, i ricercatori hanno concluso che era possibile classificare le aree del mondo in base ai livelli di resistenza.

I risultati dello studio hanno mostrato che, in generale, il Nord America, l'Europa occidentale, l'Australia e la Nuova Zelanda hanno i più bassi livelli di batteri resistenti mentre Asia, Africa e Sud America si trovano all'altra estremità dello spettro.





Hendriksen RS, Munk P, Njage P, van Bunnik B, McNally L, Lukjancenko O, Röder T, Nieuwenhuijse D, Pedersen SK, Kjeldgaard J, Kaas RS, Clausen PTLC, Vogt JK, Leekitcharoenphon P, van de Schans MGM, Zuidema T, de Roda Husman AM, Rasmussen S, Petersen B; Global Sewage Surveillance project consortium, Amid C, Cochrane G, Sicheritz-Ponten T, Schmitt H, Alvarez JRM, Aidara-Kane A, Pamp SJ, Lund O, Hald T, Woolhouse M, Koopmans MP, Vigre H, Petersen TN, Aarestrup FM. Global monitoring of antimicrobial resistance based on metagenomics analyses of urban sewage. Nat Commun 2019 Mar 8;10(1):1124.